美国有五大生物技术产业基地，分别是波士顿、旧金山湾、华盛顿、圣迭戈和北卡研究三角园。他们不仅是地方的经济支柱，更是美国该产业规模化的基础，带动全美其他地区的产业发展。相应地，美国生物技术产业目前主要集中在九大都市区：波士顿、洛杉矶、纽约、费城、洛丽-杜朗、圣迭戈、旧金山、西雅图、华盛顿/巴尔的摩。上述五大产业基地崛起的原因、凭借的优势、自身的特点和以后的发展方向各不相同，接下来简单介绍一下他们的情况。

波士顿

波士顿地区名校林立，学术气息浓厚，如哈佛大学Harvard University, 麻省理工学院MIT, 波士顿大学Boston University, 东北大学Northeastern University, 波士顿学院Boston College, 塔夫兹大学Tufts University, 布兰代斯大学Brandeis University和伍斯特理工学院WPI等等。与其他高科技产业相比，生物技术产品的研发完全依赖于科研机构与大学实验室，这与他特有的产业特性不无关系。由于产品生命周期长（一般需要5-10年研发一种新药物），行业企业之间的竞争并不激烈，而真正推动企业发展、产品研发的是靠科研机构与大学高校。除了一流的大学外，波士顿还有很多国际顶尖的医院，如哈佛大学麻省附属总医院、布莱根妇女医院、Beth Israel Deaconess Medical Center等。

旧金山湾

和波士顿地区一样，旧金山湾区也拥有加利福尼亚大学旧金山分校University of California, San Francisco和加利福尼亚大学伯克利分校University of California, Berkeley以及斯坦福大学Stanford University等蛮声全球的名校。其中，斯坦福研究园(Stanford Research Park)是美国第一个高技术研究园，由它影响和塑造的硅谷(Silicon Valley)已成为名副其实的美国高科技产业基地和知识经济的发源地，成为全球最有创造力的地区和全球高端因素最集中的地区。斯坦福研究园依靠斯坦福大学雄厚的知识、技术、人才资源和出租校园土地，吸引各种企业、机构入园，研究领域主要涉及电子、航天、生物技术及计算机软件与硬件等。

圣地亚哥

与其他地区相比，圣地亚哥地区生物技术产业发展的最大亮点是其充足的经费支持。加利福尼亚大学圣地亚哥分校则是全美大学中获得美国联邦科研费用最多的高校之一。该地区得到的年研究开发经费达70亿美元,超过了大多数发展中国家的年科研预算。同时，该校的生物学研究也得到了当地生物企业的有力帮助。

华盛顿

大华府地区（指华盛顿特区和紧靠华盛顿的马里兰南部和弗吉尼亚北部地区）则云集了一批世界级的教学、研究、管理机构，如美国国家卫生研究院NIH、美国食品和药物管理局FDA、霍华德.休斯医学院研究实验室、马里兰大学University of Maryland研究中心和约翰斯.霍普金斯大学Johns Hopkins University等。与旧金山湾区一样，世界第一大因特网服务商美国在线American Online和其他一系列信息巨头使得大华府也成为 “生物技术加计算机科学基础设施”的完美组合。蒙哥马利县集中了马里兰州三分之二的生物技术公司，包括塞莱拉Celera、人类基因组科学公司Human Genome Sciences等大型公司。

北卡研究三角园

北卡罗来纳州研究三角园(Research Triangle Park)以“三角”命名，是由于其位于美国南方北卡罗来纳州的罗利、杜兰和查佩尔希尔三个主要城市之间的交接地带，并被北卡罗来纳大学、北卡罗来纳州立大学和杜克大学三所名校环绕，形状类似一个不规则的三角形。